Sinc.- The Earth Microbiome Project (Proyecto Microbioma Terrestre) es un tit谩nico proyecto realizado por un equipo internacional donde participan investigadores de la Universidad de Granada (UGR) desde 2012. Utilizando los m谩s recientes m茅todos de secuenciaci贸n de ADN han obtenido m谩s de 2.200 millones de secuencias, de las cuales 305.000 son completamente nuevas para la ciencia. Los resultados preliminares se han publicado en la revista Nature.
Para llevar a cabo esta tarea a escala planetaria se ha contado con la colaboraci贸n de investigadores de alrededor del globo. Hasta ahora, el proyecto se ha expandido por 43 pa铆ses, desde el 脕rtico a la Ant谩rtida. Pero el Earth Microbiome Project va todav铆a m谩s all谩. Esta enorme informaci贸n forma parte de unos 100 estudios, la mitad de ellos ya publicados en revistas internacionales y la otra mitad en proceso de publicaci贸n.
El objetivo es muestrear tantas comunidades bacterianas de la Tierra como sea posible, para poder avanzar en nuestro conocimiento cient铆fico de los microbios y sus relaciones con el ambiente, incluyendo plantas, animales y por supuesto humanos. Gracias al Earth Microbiome Project se ha conseguido analizar una colecci贸n amplia de microorganismos –el microbioma– que ha permitido generar la primera base de datos de referencia de las bacterias que colonizan el planeta.
En la actualidad, las t茅cnicas de secuenciaci贸n masiva de ADN permiten analizar miles de muestras; pero desde el Earth Microbiome Project se han desarrollado herramientas bioinform谩ticas que permiten relacionar esas comunidades bacterianas con las variables ambientales donde viven. Gracias a protocolos estandarizados, el uso de secuenciaci贸n masiva, m茅todos anal铆ticos novedosos y a una filosof铆a de “acceso abierto”, el proyecto contin煤a creciendo y mejorando a medida que se van a帽adiendo nuevos datos.
Debido a la gran importancia de los microorganismos para el medio ambiente, la salud humana y la industria, son numerosos los estudios que se centran en analizar los microorganismos que intervienen en distintos procesos, pero siempre bajo un punto de vista muy local y ambientes muy espec铆ficos.
Conociendo los microorganismos de toda la Tierra
En este art铆culo se aborda la diversidad microbiana a escala mundial y pretende promover el estudio de patrones generales de la diversidad y ecolog铆a de la comunidad bacteriana de la Tierra. En general, los microbiomas asociados a un organismo vivo son muy diferentes y menos diversos que aquellos que viven de forma libre, como los que se encuentran en el suelo o el agua.
Pero adem谩s la diversidad de ambientes muestreados por el Earth Microbiome Project ayuda a demostrar la influencia del ambiente local en el microbioma. Por ejemplo, las comunidades de ambientes salinos se parecen m谩s entre ellas que a las de ambientes de agua dulce y a su vez son m谩s parecidas entre ellas que a las comunidades de la piel de cet谩ceos y peces que viven en esas aguas.
Los investigadores de la UGR aportan dos de estos estudios al proyecto: el microbioma de la c谩scara de los huevos de una comunidad de aves del sureste peninsular; y el papel de la temperatura y la humedad en la microbiolog铆a de los huevos del estornino negro.
Ambos estudios son liderados por Juan Manuel Peralta S谩nchez, que actualmente disfruta de un contrato postdoctoral en la Estaci贸n Biol贸gica de Do帽ana, CSIC. Peralta analiz贸 las muestras de ambos estudios en el laboratorio de Rob Knight, col铆der del Earth Microbiome Project .
Este trabajo sienta las bases para el estudio de patrones ecol贸gicos globales y ofrece un ejemplo de trabajo internacional, multidisciplinar y coordinado. Seg煤n los cient铆ficos, el Earth Microbiome Project es una fuente de recursos para la exploraci贸n de cientos de preguntas ecol贸gicas que est谩n pendientes de resolver.
Referencia bibliogr谩fica:
Luke Thompson et al. "A communal catalogue reveals Earth’s multiscale microbial diversity" Nature